Safiye Sultan'ın bilinen çocukları şunlardır:
I. Mehmet: https://www.nedemek.page/kavramlar/I.%20Mehmet - Osmanlı İmparatorluğu'nun padişahı. Annesi büyük olasılıkla Safiye Sultan'dır.
Şehzade Mahmud: https://www.nedemek.page/kavramlar/Şehzade%20Mahmud - III. Mehmed'in oğlu ve Safiye Sultan'ın oğludur.
Ayşe Sultan: https://www.nedemek.page/kavramlar/Ayşe%20Sultan - Safiye Sultan'ın kızıdır.
Fatma Sultan: https://www.nedemek.page/kavramlar/Fatma%20Sultan - Safiye Sultan'ın kızıdır.